ИТ-аккредитация не отменяет лимиты доходов на УСН

Региональные льготы по УСН часто воспринимаются бизнесом как устойчивое право на пониженную ставку. На практике это не так: льготная ставка действует только в пределах, которые допускает Налоговый кодекс. Если федеральные правила предусматривают обязательный переход на повышенную ставку после превышения доходного лимита, региональный закон не может отменить это требование.

Именно такой спор рассмотрел Арбитражный суд Новосибирской области (постановление от 05.05.2026 г. по делу № А45-41041/2025). Аккредитованная ИТ-компания применяла УСН с объектом «доходы минус расходы» и рассчитала налог по региональной ставке 5%. Однако ее годовой доход превысил предел, после которого в спорный период должна была применяться ставка 20%. Суд поддержал налоговую инспекцию.

[button text="Применяете региональную льготу по УСН? Проверим пределы ее действия"]

ООО с момента регистрации применяло УСН с объектом «доходы, уменьшенные на величину расходов». Компания занималась деятельностью в области информационных технологий и имела государственную аккредитацию.

За 2024 год организация представила декларацию по УСН, в которой указала налог по ставке 5%. Эта ставка была установлена законом Новосибирской области для аккредитованных ИТ-компаний при соблюдении требований к структуре доходов.

Доход компании за 2024 год составил 220 976 434 рубля. С учетом действовавшего коэффициента-дефлятора порог, после превышения которого применялась повышенная ставка, составлял 199,35 млн рублей. При этом компания не превысила максимальный предел для сохранения права на УСН — 265,8 млн рублей.

По итогам камеральной проверки инспекция пришла к выводу, что организация сохранила право применять УСН, но за четвертый квартал должна была рассчитывать налог по ставке 20%, а не 5%. В результате компании доначислили 7 778 159 рублей налога и штраф в размере 1 556 632 рублей.

Спор с налоговиками возник из-за соотношения двух норм:

• регионального закона, устанавливавшего ставку 5% для аккредитованных ИТ-компаний;
• федеральной нормы Налогового кодекса, предусматривавшей ставку 20% при превышении установленного доходного лимита (действовала до 31.12.2024 года).

Компания полагала, что региональная льгота продолжает действовать независимо от размера дохода, поскольку в региональном законе прямо не было указано, что ставка 5% прекращает применяться после превышения лимита.

Налоговая инспекция исходила из противоположного подхода: субъект РФ вправе снижать обычную ставку УСН, но не вправе изменять повышенную ставку, прямо установленную Налоговым кодексом для случаев превышения доходов или численности работников.

Компания ссылалась на несколько обстоятельств.

Во-первых, региональный закон устанавливал ставку 5% для аккредитованных IT-организаций и не содержал отдельного ограничения по максимальному доходу.

Во-вторых, компания заранее обращалась в налоговый орган с вопросом о применении ставки при возможном превышении лимита. В ответ инспекция сообщила о порядке аккредитации и возможности применять положения регионального закона, но отдельно не предупредила о необходимости перехода на ставку 20%.

В-третьих, организация утверждала, что повышенная ставка предназначена преимущественно для крупного бизнеса и не должна распространяться на IT-компании, для которых установлены специальные меры поддержки.

[button text="Получили доначисление по УСН? Оценим основания для обжалования"]

Суд разграничил обычные и повышенные ставки УСН.

Регион действительно вправе устанавливать пониженную ставку для отдельных категорий налогоплательщиков. Однако это полномочие касается базовой ставки по УСН. Для компаний с объектом «доходы минус расходы» субъект РФ мог снизить ее в установленных НК РФ пределах.

Повышенная ставка 20% регулировалась отдельной нормой. Эта норма не предусматривала права регионов изменять ее размер или вводить исключения для отдельных категорий налогоплательщиков.

Поэтому после превышения доходного лимита компания:

• не утратила право на УСН;
• не должна была переходить на общую систему налогообложения задним числом;
• но обязана была применять ставку 20% к налоговой базе, относящейся к периоду превышения.

Суд также отклонил довод о специальном положении ИТ-компаний.

Наличие аккредитации дает право на предусмотренные законом льготы, но не создает самостоятельного налогового режима и не отменяет императивные ограничения Налогового кодекса. Иной подход означал бы, что налогоплательщики с одинаковым размером доходов несли бы разную налоговую нагрузку без прямого основания в федеральном законе.

Таким образом, ИТ-льготы необходимо применять только после совместного анализа регионального закона, федеральных лимитов УСН и фактической динамики доходов компании.

Компания пыталась сослаться на ранее полученный ответ налоговой инспекции.

Однако суд установил, что письмо носило общий информационный характер. В нем разъяснялись вопросы аккредитации и возможность применения региональной льготы, но не содержалось прямого вывода о том, что ставка 5% сохраняется после превышения доходного лимита.

Поэтому это письмо не было признано письменным разъяснением, исполнение которого исключает вину налогоплательщика.

Суд отдельно отметил важный принцип: даже надлежащее письменное разъяснение уполномоченного органа в определенных случаях может освободить от штрафной ответственности, но не отменяет саму обязанность уплатить правильно рассчитанный налог.

Иными словами, ссылка на позицию инспекции потенциально может помочь в споре о штрафе, но не всегда позволяет избежать доначисления налога.