Резидентам Сколково отменили право выбора налоговых льгот с 2026 года

Резиденты проекта «Сколково» имеют право на налоговые льготы. При этом до недавнего времени у них была возможность выбора права использования пониженного тарифа по взносам – либо как для участникам проекта, либо как для ИТ-компании. С 2026 года они лишаются права совмещать льготы, предусмотренные проектом «Сколково» и налоговым маневром в ИТ-отрасли. 

Так, организация, получившая статус участника проекта по осуществлению исследований, разработок и коммерциализации их результатов в соответствии с Федеральным законом от 28.09.2010 № 244-ФЗ «Об инновационном центре «Сколково» имеет право:

• на освобождение от обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой НДС, в течение 10 лет со дня получения организацией статуса участника проекта (п. 1 ст. 145.1 Налогового кодекса);
• на освобождение от исполнения обязанностей налогоплательщиков налога на прибыль в течение 10 лет со дня получения ими статуса участника проекта (п. 1 ст. 246.1 Налогового кодекса);
• на пониженные тарифы страховых взносов. Применять такие тарифы можно в течение 10 лет со дня получения статуса участника проекта. Размер льготного тарифа по взносам — 15%. Он применяется к части выплат в пользу физлица, которая превышает по итогам каждого месяца полуторакратный МРОТ, установленный на начало календарного года. К выплатам, которые не превышают МРОТ, применяется обычный единый тариф взносов на ОПС, ОМС и ВНиМ — 30% (пп. 10 п. 1, п. 2.4, п. 9 ст. 427 Налогового кодекса).

При этом организация - участник проекта «Сколково», одновременно осуществляющая деятельность в области ИТ и выполняющая все необходимые условия для применения пониженных тарифов страховых взносов, вправе выбрать тарифы страховых взносов и соответствующий порядок их применения, предусмотренные:

• для участников проекта «Сколково»;
• либо для организаций, осуществляющих деятельность в области ИТ.

При этом выбор плательщиком страховых взносов пониженных тарифов страховых взносов, установленных для одной из вышеуказанных льготных категорий плательщиков страховых взносов, не ставится в зависимость от применения им преференций по НДС и налогу на прибыль.

На это обратил внимание Минфин в письмах от 11.10.2024 № 03-03-06/1/98497, от 09.09.2022 № 03-15-06/87543, от 14.09.2021 № 03-15-06/74333.

Согласно пункту 1 статьи 145.1 и пункту 1 статьи 246.1 Налогового кодекса организация - участник проекта «Сколково» в течение 10-ти лет со дня получения статуса участника проекта «Сколково» имеет право на освобождение от обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой НДС, а также на освобождение от исполнения обязанностей налогоплательщика налога на прибыль.

Минфин также отмечал, что при одновременном соблюдении организацией условий, предусмотренных для применения права на освобождение от обязанностей налогоплательщика по налогу на прибыль, а также для применения льготной налоговой ставки по налогу на прибыль налогоплательщик самостоятельно осуществляет выбор налоговых преференций по указанному налогу независимо от выбора оснований для исчисления и уплаты страховых взносов, а также от применения права на освобождение от обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой НДС.

То есть, резиденты проекта вправе использовать освобождение от налога на прибыль и НДС по правилам для участника проекта «Сколково» и пониженными тарифами по взносам, предусмотренными для ИТ-отрасли.

С 2026 года резиденты «Сколково» лишаются этого права. Они не смогут использовать льготы по налогу на прибыль и пониженные взносы, установленные для ИТ-компаний.

С 2026 года предусматривается, что вне зависимости от выполнения иных условий, льготная ставка по налогу на прибыль и льготный тариф по страховым взносам, установленные для ИТ-компаний, не подлежат применению компанией, имеющей статус участника проекта «Сколково» (абз. 22 п. 1.15 ст. 284, абз. 23 п. 5 ст. 427 Налогового кодекса в редакции, действующй с 2026 года).

Это предусматривается Федеральным законом от 28.11.2025 № 425-ФЗ, который внес многочисленные поправки в Налоговый кодекс, действующие с 2026 года.