Как применять налоговые ИТ льготы при утрате статуса резидента Сколково

С 2026 года совмещать налоговые льготы, установленные для резидентов «Сколково» аккредитованных ИТ-компаний больше нельзя. Однако, при утрате статуса участника проекта «Сколково» у компании есть возможность дальнейшего применения пониженных ставок по налогу на прибыль и льготных тарифов по взносам, установленных для ИТ-компаний. В связи с этим нужно учитывать особенности, связанные с началом применения этих преференций.

Резиденты «Сколково» вправе пользоваться освобождением от обязанностей плательщика налога на прибыль по статье 246.1 Налогового кодекса в течение 10 лет со дня получения статуса, но теряют это право, в частности, при утрате статуса участника проекта или при превышении годовой выручки в 1 млрд рублей. При утрате статуса сумма налога за соответствующий налоговый период подлежит восстановлению и уплате с пенями.

С 1 января 2026 года ставка по пункту 1.15 статьи 284 Налогового кодекса для ИТ-организаций не применяется к организациям, имеющим статус участника проекта. Поэтому ИТ-компания, которая остается участником проекта, не вправе в 2026 году применять ставку 5% в федеральный бюджет и 0% в региональный бюджет, даже если у нее есть госаккредитация и соблюдается 70%-й критерий профильных доходов.

Для того, чтобы бывший резидент «Сколково» смог начать применение пониженных ставок по налогу на прибыль, нужно учесть следующее.

Если ИТ-компания утрачивает статус участника проекта внутри налогового периода, то пониженные ИТ-ставки по налогу на прибыль она, по мнению Минфина, сможет применять только с начала следующего налогового периода. То есть фактически с 1 января следующего года. Но при условии наличия документа о госаккредитации организации, осуществляющей деятельность в области информационных технологий, и выполнении соответствующего условия о 70-процентной доле доходов от деятельности в сфере ИТ.

Утрата статуса участника проекта возможна, в частности, при досрочном исключении из реестра, в том числе вследствие отказа от участия в проекте. То есть добровольный выход из проекта «Сколково» по последствиям приравнивается к обычной утрате статуса.

В отношении права на применение льготных тарифов по страховым взносам действует иное правило.

Для участников проекта действует льготный тариф по пункту 2.4 статьи 427 Налогового кодекса: 15% только в отношении части выплат сверх 1,5 МРОТ. При утрате статуса этот режим перестает применяться с 1-го числа месяца, в котором статус утрачен.

Для обычных аккредитованных ИТ-компаний с 2026 года действует другой режим: 15% в пределах единой предельной базы и 7,6% сверх нее, при наличии аккредитации и соблюдении 70%-й доли профильных доходов. Минфин отдельно подчеркивает, что эти ИТ-тарифы не применяются к организациям, имеющим статус участников проекта.

При этом в части начала применения льгот по взносам Минфин допускает более быстрый переход — если компания с ИТ-аккредитацией утратила статус участника проекта в январе 2026 года, то при выполнении 70%-го условия она вправе применять пониженный тариф по страховым взносам с месяца утраты статуса резидента «Сколково».

Таким образом, по взносам переход на использование льгот возможен внутри года, а по налогу на прибыль — только со следующего налогового периода. К такому выводу пришли чиновники в письме от 18.02.2026 г. № 03-03-07/12137.