Как получать налоговые льготы в преференциальных налоговых режимах

С 1 апреля 2026 года действуют меры, уточняющие условия предоставления налоговых льгот резидентам (участникам) преференциальных налоговых режимов. Изменения связаны в связи со вступлением в силу Федерального закона от 11.02.2026 № 18-ФЗ.

Налоговый кодекс дополнен новой статьей 56.1, установившей особенности применения пониженных налоговых ставок, налоговых льгот, пониженных тарифов страховых взносов резидентами (участниками) территорий с преференциальным режимом.

Речь идет о резидентах и участниках:

• территории опережающего развития;
• свободного порта Владивосток;
• Арктической зоны;
• особой экономической зоны, в том числе в Калининградской области;
• свободной экономической зоны в Крыму и Севастополе.

Так, резиденты (участники) территорий с преференциальным режимом, получившие соответствующий статус начиная с 1 апреля 2026 года, являющиеся организациями, применяют в текущем календарном году пониженные налоговые ставки, налоговые льготы, пониженные тарифы страховых взносов, если они одновременно отвечают следующим требованиям:

не привлекались более 2-х раз в течение 3-х календарных лет, непосредственно предшествующих 1 января текущего календарного года, к 2 административной ответственности в связи с непредставлением в налоговый орган по месту своего учета бухгалтерской (финансовой) отчетности;

по состоянию на 31 декабря календарного года, непосредственно предшествующего текущему календарному году, выполняют отдельные обязательства, установленные соглашением (договором, инвестиционной декларацией) об осуществлении (условиях) деятельности на территориях с преференциальным режимом.

Невыполнение указанных условий влечет приостановление применения налоговых льгот с  возможностью возобновления их применения в последующих налоговых периодах при условии выполнения установленных условий.

При этом перечень показателей, характеризующих выполнение указанных обязательств, будет определяться законом субъекта Российской Федерации, на территории которого осуществляется соответствующая деятельность, с учетом объемов осуществленных резидентами преференциальных режимов капитальных вложений и расходов на НИОКР.

Законом субъекта Российской Федерации, на территории которого осуществляется деятельность в рамках соглашения, могут быть установлены иные значения (отличное от 1, в том числе значение, равное нулю) отношения объема осуществленных налогоплательщиком – резидентом преференциального режима в рамках реализации соглашения капитальных вложений или расходов на НИОКР к величине налоговых льгот.

При этом Правительство наделяется правом определять дополнительные условия установления законом субъекта Российской Федерации значения указанного отношения ниже 1.

Указанные законы субъектов Российской Федерации подлежат принятию законодательными органами субъектов Российской Федерации не позднее 1 декабря 2027 года.

В целях подтверждения выполнения резидентом обязательств по соглашению законом субъекта Российской Федерации определяется перечень показателей и допустимые пределы отклонений фактических их значений от установленных соглашением.

Указанный перечень должен содержать показатели количества рабочих мест, создаваемых в рамках реализации соглашения, размера капитальных вложений, осуществляемых в рамках его реализации, а также иные обязательства, предусмотренные условиями соглашения.

Для контроля за соблюдением условий применения налоговых льгот резидент ежегодно в срок не позднее 25 марта текущего календарного года представляет в налоговый орган расчет осуществленных им инвестиционных расходов и расчетную величину соответствующих налоговых обязательств с учетом и без учета налоговых льгот по состоянию на 31 декабря предыдущего года.

Кроме того, управляющая компания и орган государственной власти региона направляют в налоговый орган информацию о выполнении резидентом отдельных обязательств по соглашению не позднее 15 мая текущего года.

При определении инвестиционных расходов будут учитываться капитальные расходы в ОС и НМА (в части прав на изобретения, промышленные образцы, полезные модели, программы для электронных вычислительных машин и базы данных) и расходы на НИОКР, осуществленные с момента получения статуса резидента, без применения повышающего коэффициента 2, предусмотренного Налоговым кодексом.

При этом не учитываются расходы на строительство и реконструкцию жилых помещений, расходы на приобретение ранее учтенного имущества и результатов НИОКР у взаимозависимых лиц или за счет бюджетных средств, расходы в виде остаточной стоимости полученного имущества в порядке правопреемства при реорганизации юридических лиц, а также расходы на приобретение легковых автомобилей, мотоциклов, спортивных, туристских и прогулочных судов (за исключением случаев реализации туристско-рекреационных проектов в Калининградской области либо оказания туристических услуг другими резидентами).

Также предусматривается, что законом субъекта Российской Федерации, на территории которого осуществляется деятельность в рамках соглашения, может быть установлено право налогоплательщика на ежегодную индексацию объемов капитальных вложений, осуществленных налогоплательщиком – резидентом преференциального режима в рамках реализации соглашения, на индекс-дефлятор инвестиций в основной капитал, предусмотренный прогнозом социально-экономического развития Российской Федерации на среднесрочный период.

Новый механизм применения налоговых льгот будет распространяться на новых резидентов, заключивших соглашение после 1 апреля 2026 года.

При этом предусматривается отсрочка начала применения указанного механизма в течение 3-х календарных лет начиная с года получения статуса резидента, что обусловлено отсутствием значительных инвестиционных затрат на начальной стадии реализации инвестиционного проекта.