Можно ли совмещать налоговые льготы для МТК и резидентов ТОР

Получение компанией сразу нескольких льготных статусов не всегда означает, что предусмотренные для них налоговые преференции можно свободно совмещать. Такая проблема возникает, когда резидент территории опережающего развития одновременно приобретает статус МТК. Оба режима предусматривают пониженные ставки, однако имеют разные основания, условия и порядок применения.

В письме от 01.07.2026 г. № 03-03-06/1/56278 Минфин разъяснил, как разграничить льготы по налогу на прибыль и страховым взносам в подобной ситуации. Ключевым становится выбранный резидентом ТОР способ формирования налоговой базы. При этом, если пониженные ставки применяются ко всей прибыли организации, дополнительно воспользоваться льготой МТК нельзя. Если же прибыль от деятельности по соглашению на ТОР учитывается отдельно, режим МТК потенциально можно применить к иной деятельности.

Резиденты ТОР и малые технологические компании относятся к разным льготным категориям налогоплательщиков.

Резидент ТОР получает преференции в связи с реализацией проекта на определенной территории и исполнением соглашения об осуществлении деятельности. Статус МТК, напротив, связан с технологическим характером бизнеса и включением организации в специальный реестр.

Положениями Налогового кодекса налогоплательщику - резиденту ТОР предоставлено право выбора способа применения пониженных налоговых ставок по налогу на прибыль.

Для резидентов ТОР (ст. 284.4 Налогового кодекса) есть 2 варианта применения пониженных ставок по налогу на прибыль:

• ко всей налоговой базе — если доходы от деятельности по соглашению на ТОР составляют не менее 90% всех доходов (без учета положительной курсовой разницы по п. 11 ч. 2 ст. 250 Налогового кодекса). Это удобно, когда бизнес фактически сконцентрирован на проекте ТОР;
• к отдельной налоговой базе по деятельности в рамках соглашения — при условии ведения раздельного учета доходов и расходов по каждому соглашению и по иной деятельности. Подходит, если у компании есть и другие направления.

Таким образом, пониженная ставка по налогу на прибыль, подлежащему зачислению в региональный бюджет, применяется в зависимости от выбора налогоплательщика - резидента ТОР либо ко всей налоговой базе, либо к отдельной налоговой базе (письмо Минфина от 18.03.2026 № 03-03-06/1/21759).

Для малых технологических компаний Налоговый кодекс не устанавливает единую федеральную пониженную ставку по налогу на прибыль. Для МТК (п. 18.5 ст. 284 Налогового кодекса) пониженная ставка по налогу на прибыль, зачисляемому в бюджет субъекта РФ, может устанавливаться законами субъектов на 2025 – 2030 годы. Это отдельная региональная преференция.

В 2025 – 2030 годах пониженная ставка по части налога, поступающей в региональный бюджет, может вводиться законами субъектов РФ. Поэтому после включения в реестр МТК компании необходимо дополнительно проверить региональное законодательство.

Следует установить:

• действует ли в субъекте РФ льгота для МТК;
• с какого периода она применяется;
• каков размер пониженной ставки;
• предусмотрены ли дополнительные требования;
• распространяется ли региональная льгота на конкретную организацию.

Само включение в реестр МТК еще не означает автоматического уменьшения налога.

Минфин исходит из того, что резиденты ТОР и организации, включенные в реестр МТК, являются отдельными категориями налогоплательщиков. Для каждой категории предусмотрены собственные условия, сроки и порядок применения пониженных ставок.

Поэтому две льготы нельзя одновременно применять к одной и той же налоговой базе.

Если ставки ТОР применяются ко всей прибыли, организация не может дополнительно воспользоваться пониженной ставкой для МТК. Вся налоговая база уже охвачена льготным режимом резидента ТОР. Получение статуса МТК в течение этого периода не создает дополнительной части прибыли, к которой можно было бы применить вторую льготу.

Если база по деятельности на ТОР выделена отдельно, в этом случае применение двух режимов возможно, но к разным налоговым базам:

• если получена прибыль от деятельности по соглашению на ТОР, применяются пониженные ставки резидента ТОР;
• если получена прибыль от иной деятельности, возможна пониженная региональная ставка для МТК.

Минфин пришел к выводу, что если налогоплательщик - резидент ТОР в течение применения соответствующих пониженных налоговых ставок по налогу на прибыль включается в реестр МТК и получает соответствующий статус, то он может применять пониженные налоговые ставки по налогу на прибыль, установленные для российских организаций, включенных в реестр МТК, исключительно к налоговой базе, сформированной налогоплательщиком от иной деятельности, не относящейся к деятельности, осуществляемой при исполнении соглашения.

То есть, если ставки ТОР применяются ко всей налоговой базе, льгота МТК по налогу на прибыль не используется. Если же база по деятельности в рамках соглашения выделена отдельно, региональная ставка для МТК может применяться к прибыли от иной деятельности.

В случае применения налогоплательщиком - резидентом ТОР пониженных налоговых ставок по налогу на прибыль ко всей налоговой базе, такой налогоплательщик не может применять пониженные налоговые ставки по налогу на прибыль, установленные для российских организаций, включенных в реестр МТК.

По сути, Минфин допускает не суммирование двух льгот, а их параллельное применение к разным направлениям деятельности.

Для этого организация должна доказать, какая прибыль получена:

• от деятельности по соглашению на ТОР;
• от иной деятельности;
• от проектов, соответствующих условиям региональной льготы для МТК.

Необходимо разделять не только доходы, но и связанные с ними расходы. Особое внимание потребуется уделить затратам, которые одновременно относятся к нескольким направлениям: заработной плате административного персонала, аренде, амортизации, программному обеспечению, коммунальным и общехозяйственным расходам.

Порядок распределения таких затрат желательно заранее закрепить в учетной политике. Методика должна быть экономически обоснованной, последовательной и подтверждаться регистрами налогового учета.

Если компания не сможет достоверно отделить деятельность на ТОР от иной деятельности, налоговый орган может поставить под сомнение применение второй льготы и пересчитать налог по общей ставке.

Кроме того, для резидентов ТОР статья 427 Налогового кодекса предусматривает единый пониженный тариф страховых взносов в размере 7,6%.

Для резидентов ТОР, не расположенных в Дальневосточном федеральном округе, тариф применяется:

• в течение 12 лет со дня получения статуса резидента;
• в отношении выплат сотрудникам, занятым на новых рабочих местах;
• при соблюдении специальных условий НК РФ.

Минфин отдельно подчеркнул, что право резидента ТОР применять пониженный тариф страховых взносов не зависит от использования налоговых льгот.

Следовательно, выбор способа применения ставок по налогу на прибыль сам по себе не лишает организацию тарифа 7,6%. Налог на прибыль и страховые взносы необходимо анализировать раздельно.

При этом компания должна документально подтверждать, что конкретные сотрудники действительно заняты на новых рабочих местах, созданных в связи с реализацией проекта на ТОР.