Новый порядок включения резидентов ИНТЦ в реестр субъектов МСП

Принят Федеральный закон от 25.05.2026 № 154-ФЗ «О внесении изменений в Федеральный закон «О развитии малого и среднего предпринимательства в Российской Федерации».

Закон направлен на урегулирование случаев, когда субъекты МСП, имеющие доход до одного миллиарда рублей и являющиеся участниками инновационных научно-технологических центров (далее – ИНТЦ), не представляют налоговую отчетность, реализуя предусмотренное законодательством право, однако, поскольку ФНС не обладает необходимыми сведениями о доходах таких субъектов МСП, данные о них исключаются из реестра МСП.

Статус МСП носит межотраслевой характер и его могут получить все хозяйствующие субъекты, которые по общему правилу, соответствуют требованиям к уставному капиталу, среднесписочной численности работников и доходу. При этом если хозяйствующий субъект не соответствует какому-либо критерию, то он не может быть признан субъектом МСП.

Сведения о том, что хозяйствующий субъект является субъектом МСП, отражаются в публичном реестре МСП, одна часть данных в который передается уполномоченными органами (организациями) (например, данные
от реестродержателей акционерных обществ), а другая – в автоматическом режиме (например, сведения о доходе).

Вместе с тем отдельные категории налогоплательщиков освобождены от такой обязанности. Например, участники ИНТЦ, резиденты «Сколково».

Набор преференций для лиц, участвующих в реализации проекта ИНТЦ идентичен такому набору для резидентов «Сколково».

Так, например, для участников ИНТЦ предусмотрены следующие льготы и преференции:

• право в течение 10 лет со дня получения им такого статуса на освобождение от обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой следующих налогов — НДС, налога на прибыль, налога на имущество;
• предоставление субсидий на возмещение затрат по уплате таможенных платежей в форме авансовых платежей за счет средств федерального бюджета;
• пониженные тарифы страховых взносов в размере 15% — в отношении части ежемесячных выплат, которая превышает полуторакратный МРОТ, установленный на начало года.

Несмотря на незначительное количество расхождений в инструментах поддержки субъектов МСП и участников ИНТЦ, если последние формально соответствуют критериям отнесения к субъектам МСП, но налоговую отчетность не подали (реализовали свое право право), то они лишаются:

• финансовой, имущественной, информационной, консультационной поддержки, поддержки в области инноваций и промышленного производства;
• права в упрощенном порядке вести бухгалтерский и налоговый учет, а также составлять статистическую отчетность;
• в квотировании при государственных закупках.

На практике возникают случаи, когда субъекты МСП становятся участниками ИНТЦ и не представляют налоговую отчетность (то есть реализуют право, которое предусмотрено налоговым законодательством). Следовательно, данные о таких лицах подлежат исключению из реестра МСП, поскольку ФНС не обладает необходимыми сведениями о доходах.

По данным разработчиков законопроекта в 2023 году из 392 участников ИНТЦ 283 хозяйствующих субъекта представили в ФНС налоговую отчетность, хотя от этой обязанности освобождены.

Кроме того, еще 101 участник ИНТЦ не включен в реестр МСП по разным основаниям, в том числе 53 лица в связи с непредставлением налоговой отчетности, позволяющей определить доход, полученный от предпринимательской деятельности за 2023 год.

Актуализация данных в реестре за предыдущий год происходит после обновления реестра МСП 10 июля текущего.

Таким образом, хозяйствующие субъекты, которые формально отвечают требованиям, предъявляемым к субъектам малого и среднего бизнеса, из реестра МСП исключаются и лишаются ряда инструментов поддержки. 

Также возникают случаи, когда хозяйствующие субъекты перестают быть участниками проекта ИНТЦ в период с 1 января по 30 июня. Такие лица налоговую декларацию не представляют, но управляющая компания их уже не включает в перечень участников ИНТЦ. Получается, что такие организации не включаются в реестр МСП, формируемый по сведениям за год, в котором они освобождены от представления налоговой отчетности.

В связи с этим было предложено приравнять участников проекта «Сколково» и резидентов ИНТЦ в части включения их в реестр МСП с использованием только значения среднесписочной численности работников за предшествующий календарный год в целях определения к категории субъекта МСП.

Новый закон вносит ряд изменений в Федеральный закон от 24.07.2007 года № 209-ФЗ «О развитии малого и среднего предпринимательства в Российской Федерации», далее — Закон № 209-ФЗ:

1. устанавливается, что юридические лица, которые получили статус участника проекта ИНТЦ, признаются субъектами МСП по аналогии с участниками инновационного центра «Сколково»;

2. предусматривается упрощение механизма включения вышеназванных юридических лиц, которым предоставляется право на освобождение от исполнения обязанности налогоплательщика по представлению налоговой отчетности, позволяющей определять величину дохода, полученного от осуществления предпринимательской деятельности, в реестр МСП - в зависимости от критерия среднесписочной численности работников за предшествующий календарный год;

3. в целях ведения единого реестра МСП уточняется порядок представления в уполномоченный орган ежегодно с 1 по 5 июля соответствующих сведений:

• управляющими компаниями - перечня и реестра юридических лиц, получивших статус участника проекта, в соответствии с Федеральным законом № 216-ФЗ;
• федеральным органом исполнительной власти, уполномоченным Правительством, - перечня управляющих компаний, осуществляющих по состоянию на 1 июля текущего календарного года деятельность в рамках Федерального закона № 216-ФЗ;

4. предусматриваются переходные положения, в соответствии с которыми в целях актуализации сведений в едином реестре МСП в период с 1 по 5 сентября 2026 года в ФНС, обязываются представить:

• управляющие компании - перечень юридических лиц, получивших статус участника проекта ИНТЦ;
• федеральный орган исполнительной власти, уполномоченный Правительством Российской Федерации, - перечень управляющих компаний.

Таким образом, на управляющие компании ИНТЦ возлагается обязанность по представлению в ФНС сведений об участниках ИНТЦ. При этом Минэко будет направлять в ФНС перечень управляющих компаний ИНТЦ в целях актуализации данных реестра субъектов малого и среднего предпринимательства.

В связи со вступлением поправок в силу, после 10 сентября 2026 года участники инновационных научно-технологических центров уже будут включены в реестр субъектов малого и среднего предпринимательства.

Изменения вступают в силу с 1 сентября 2026 года.

Таким образом, с принятием нового закона резиденты ИНТЦ, несмотря на отсутствие отчетности, будут продолжать числиться в реестре малых предприятий.